Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF4Q15306 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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IRF4Q15306 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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