Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRKQ15262 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRKQ15262 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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