Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRD3Q15059 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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BRD3Q15059 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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