Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIXQ14938 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms