Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GBX1Q14549 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GBX1Q14549 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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