Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

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Length 4,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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FAT1Q14517 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FAT1Q14517 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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