Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms