Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP1A4Q13733 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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