Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR4Q13639 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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