Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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