Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL4AQ13619 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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