Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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