Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CAMK2DQ13557 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CAMK2DQ13557 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CAMK2DQ13557 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2DQ13557 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMK2DQ13557 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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