Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EIF4EBP1Q13541 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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