Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE3BQ13370 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms