Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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