Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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SEMA3FQ13275 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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