Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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