Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms