Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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