Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCB1Q12824 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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