Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELP6Q0PNE2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms