Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLEQ07864 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLEQ07864 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLEQ07864 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms