Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms