Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO4P98177 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO4P98177 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms