Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELF3P78545 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms