Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113P62684 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms