Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P61576 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P61576 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P61576 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms