Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms