Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB15P59190 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB15P59190 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB15P59190 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB15P59190 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB15P59190 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms