Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms