Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP9P55211 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms