Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP1B3P54709 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms