Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUCLG1P53597 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms