Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIM1P49642 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms