Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI2P48788 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms