Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGER3P43115 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms