Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAP2P40123 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAP2P40123 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAP2P40123 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAP2P40123 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAP2P40123 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAP2P40123 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAP2P40123 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAP2P40123 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAP2P40123 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAP2P40123 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAP2P40123 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms