Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RORAP35398 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RORAP35398 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RORAP35398 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RORAP35398 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms