Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFNP31947 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFNP31947 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFNP31947 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFNP31947 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms