Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms