Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA9P31269 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms