Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5DP30049 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms