Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMBRP28336 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMBRP28336 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMBRP28336 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMBRP28336 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms