Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms