Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms