Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms