Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms