Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALB2P22676 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CALB2P22676 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CALB2P22676 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALB2P22676 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CALB2P22676 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms