Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3BP20337 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms